Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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FOXO1Q12778 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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FOXO1Q12778 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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FOXO1Q12778 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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FOXO1Q12778 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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FOXO1Q12778 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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