Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
DSC2Q02487 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms