Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 SCN11A-201ENST00000302328 6500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MCCD1P59942 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms