Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACTN1P12814 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.7 ms