Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms