Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms