Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CIPCQ9C0C6 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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