Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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VGLL1Q99990 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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VGLL1Q99990 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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VGLL1Q99990 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VGLL1Q99990 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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