Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VPS72Q15906 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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