Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 SEMA5A-201ENST00000382496 11762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RYR3Q15413 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 JAKMIP2-206ENST00000616793 9272 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ZFYVE26-201ENST00000347230 9675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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RYR3Q15413 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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