Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NCF4Q15080 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCF4Q15080 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms