Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms