Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RFTN1Q14699 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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