Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GTF2H3Q13889 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms