Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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