Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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FOXE3Q13461 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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FOXE3Q13461 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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FOXE3Q13461 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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FOXE3Q13461 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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FOXE3Q13461 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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