Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms