Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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NME3Q13232 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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NME3Q13232 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NME3Q13232 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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