Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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