Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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