Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms