Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms