Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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