Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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UBXN4Q92575 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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UBXN4Q92575 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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UBXN4Q92575 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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