Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms