Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLIP4Q8N3C7 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms