Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTF1AQ7RTS3 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms