Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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