Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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