Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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