Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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