Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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