Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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