Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GRIK2Q13002 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms