Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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