Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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TTPAP49638 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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TTPAP49638 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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TTPAP49638 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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TTPAP49638 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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TTPAP49638 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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TTPAP49638 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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TTPAP49638 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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TTPAP49638 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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TTPAP49638 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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