Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TMPOP42166 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TMPOP42166 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TMPOP42166 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TMPOP42166 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms