Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NMBRP28336 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NMBRP28336 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NMBRP28336 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms