Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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PTPRCP08575 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PTPRCP08575 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRCP08575 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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