Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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TDP1Q9NUW8 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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TDP1Q9NUW8 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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TDP1Q9NUW8 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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TDP1Q9NUW8 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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TDP1Q9NUW8 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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TDP1Q9NUW8 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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