Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS21P1-201ENST00000453850 223 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NPY6R-201ENST00000503807 1112 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PRLR-202ENST00000310101 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL031584.2-201ENST00000420585 767 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00881-201ENST00000467995 589 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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