Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
GTF3C6Q969F1 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms