Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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