Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms