Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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