Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms