Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
TCIRG1Q13488 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms