Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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TOP3AQ13472 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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