Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TTPAP49638 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTPAP49638 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTPAP49638 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTPAP49638 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TTPAP49638 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTPAP49638 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTPAP49638 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTPAP49638 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms