Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 GLRA2-201ENST00000218075 3216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1P23471 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms